生物产业机械工学系旨在培养为包括人类、生物和环境在内的未来尖端农业和生物产业的发展做出贡献的人才，它是以机械和电子复合技术——机电一体化(Mechatronics)为基础，适用生物系统的工学基础和设计技术的学科。也就是说，运用机械、电器、电子和计算机等工学技术，研究农产品、食品等生物产业发展所需的生产、加工机械技术，以及储藏、包装等所需要的工学技术。最近利用信息(IT)、生物(BT)和纳米(NT)工学技术等尖端科学技术，对生物繁殖监控系统、农畜产品信息追踪制度、食品安全领域所需的生物传感器，以及在其他为保障高品质、环保型、安全的农畜产品生产、自动化、可持续的生物环境维持等多领域开展研究。

研究生课程以培养引领未来生物生产和农畜产食品发展，并且兼备生物和工学知识的高级人才为目标，主要在生物生产机械化和自动化、生物环境调节和生物能源工学、机电一体化设计工学、食品流程和物流包装工学精密加工和工学解释模拟、生物产业机械设计、可信性评估、生物系统控制仪表领域开展研究。

最近，该系正在果蔬品质非破坏性线上检测系统、粮食和果蔬综合处理系统、食品安全性检测中所需的生物传感器研发、环境友好型可持续发展农业构筑所需的精密农业等领域强化研究力度。另外，还在与园艺、畜产、食品工学等相关领域进行有机的研究合作和开展共同研究；在其他各种生物产业机械和食品加工、农作物环境改善，以及人体工学便利装备的改善、生产能力的提高等领域也进行着不懈的研究。